マルチコピー一本鎖DNA

密接に関連するMyxococcusxanthusからのmsDNAと比較したStigmatellaaurantiacaからのmsDNA 。 DNA配列の超可変ドメインは灰色で網掛けされています。ブランチGを含む高度に保存されたAGCRNA配列は、ピンク色で網掛けされています。 msDNAの前駆体型と産物型の間のRNA切断部位は赤い三角形で示されています。 Dhundaleらから再描画。 [1]

マルチコピー一本鎖DNA（マルチコピーいっぽんさディーエヌエー、英語: Multicopy signal-stranded DNA (mcDNA) ）は、2’,5’ホスホジエステル結合を介してRNA分子のグアノシンに共有結合した一本鎖DNAからなる染色体外衛星DNAの一種 [2]

発見

レトロン

機能

生合成

msDNAの合成のために提案されたメカニズム。 （A）プライマーテンプレートRNAを二次構造に折りたたむと、特定の分岐G残基の2'-OH基がプライマーとして機能し、レトロン逆転写酵素によるcDNA合成を開始できます。 （B）cDNAの合成には、テンプレート鎖のRNaseH消化が伴います。 （C）完成したmsDNA分子では、RNAテンプレートの一部がcDNAの5 '末端に結合したままです。 [3]

出典

  1. ^ “Structure of msDNA from Myxococcus xanthus: evidence for a long, self-annealing RNA precursor for the covalently linked, branched RNA”. Cell 51 (6): 1105–12. (December 1987). doi:10.1016/0092-8674(87)90596-4. PMID 2446773. 
  2. ^ “Two independent retrons with highly diverse reverse transcriptases in Myxococcus xanthus”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 87 (3): 942–5. (February 1990). Bibcode: 1990PNAS...87..942I. doi:10.1073/pnas.87.3.942. PMC 53385. PMID 1689062. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC53385/. 
  3. ^ “Retrons, msDNA, and the bacterial genome”. Cytogenetic and Genome Research 110 (1–4): 491–9. (2005). doi:10.1159/000084982. PMID 16093702. http://gcat.davidson.edu/sybr-u/Lampson_2005.pdf 2012年2月8日閲覧。. 

参考文献

  • “The msDNAs of bacteria”. Prog. Nuc. Acid Res. And Mol. Biol. 67: 65–91. (2001). doi:10.1016/S0079-6603(01)67025-9. ISBN 9780125400671. PMID 11525386. 
  • Zimmerly, Steven (2005). “Mobile introns and retroelements in bacteria”. In Mullany. The Dynamic Bacterial Genome. Advances in Molecular and Cellular Microbiology. 8. Cambridge University Press. pp. 121–148. doi:10.1017/CBO9780511541544.004. ISBN 978-0-511-54154-4 
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