Гистондеацетилаза 10

Гистондеацетилаза 10
Идентификаторы
ПсевдонимыHDAC10, HD10, histone deacetylase 10
Внешние IDOMIM: 608544 MGI: 2158340 HomoloGene: 23749 GeneCards: HDAC10
Расположение гена (человек)
22-я хромосома человека
Хр.22-я хромосома человека[1]
22-я хромосома человека
Расположение в геноме HDAC10
Расположение в геноме HDAC10
Локус22q13.33Начало50,245,183 bp[1]
Конец50,251,405 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
15-я хромосома мыши
Хр.15-я хромосома мыши[2]
15-я хромосома мыши
Расположение в геноме HDAC10
Расположение в геноме HDAC10
Локус15|15 E3Начало89,007,510 bp[2]
Конец89,012,903 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • right uterine tube

  • right hemisphere of cerebellum

  • mucosa of transverse colon
Наибольшая экспрессия в
  • muscle of thigh

  • proximal tubule

  • neural layer of retina
Дополнительные справочные данные
BioGPS
н/д
Генная онтология
Молекулярная функция
  • NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific)
  • protein deacetylase activity
  • histone deacetylase binding
  • связывание с белками плазмы
  • enzyme binding
  • гидролазная активность
  • histone deacetylase activity
  • zinc ion binding
  • deacetylase activity
  • acetylputrescine deacetylase activity
  • acetylspermidine deacetylase activity
  • связывание с ионом металла
Компонент клетки
  • цитоплазма
  • histone deacetylase complex
  • нуклеоплазма
  • клеточное ядро
Биологический процесс
  • histone H3 deacetylation
  • ДНК-зависимая регуляция транскрипции
  • negative regulation of transcription by RNA polymerase II
  • транскрипция, ДНК-зависимая
  • protein deacetylation
  • oligodendrocyte development
  • negative regulation of transcription, DNA-templated
  • histone deacetylation
  • chromatin organization
  • macroautophagy
  • positive regulation of mismatch repair
  • peptidyl-lysine deacetylation
  • Гомологичная рекомбинация
  • polyamine deacetylation
  • spermidine deacetylation
  • репарация ДНК
  • DNA recombination
  • аутофагия
  • cellular response to DNA damage stimulus
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

83933

170787

Ensembl

ENSG00000100429

ENSMUSG00000062906

UniProt

Q969S8
Q08AP5

Q6P3E7

RefSeq (мРНК)

NM_032019
NM_001159286

NM_199198

RefSeq (белок)

NP_001152758
NP_114408

NP_954668

Локус (UCSC)Chr 22: 50.25 – 50.25 MbChr 15: 89.01 – 89.01 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Гистондеацетилаза 10 (англ. Histone deacetylase 10) — фермент, кодируемый у человека геном HDAC10 [5][6][7].

Ацетилирование ядра гистонов модулирует структуру хроматина и экспрессию генов. Противоположная ферментативная деятельность гистонов ацетилтрансфераз и гистондезацетилаз, таких как HDAC10, определяет статус ацетилирования гистонов (Као и др., 2002 г.)[7].

Взаимодействия

HDAC10, как было выявлено, взаимодействует с HDAC2[8] и NCOR2[8].

См. также

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000100429 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000062906 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Kao H.Y., Lee C.H., Komarov A., Han C.C., Evans R.M. Isolation and characterization of mammalian HDAC10, a novel histone deacetylase (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — January (vol. 277, no. 1). — P. 187—193. — doi:10.1074/jbc.M108931200. — PMID 11677242.
  6. ↑ Guardiola A.R., Yao T.P. Molecular cloning and characterization of a novel histone deacetylase HDAC10 (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — January (vol. 277, no. 5). — P. 3350—3356. — doi:10.1074/jbc.M109861200. — PMID 11726666.
  7. ↑ 1 2 Entrez Gene: HDAC10 histone deacetylase 10  (неопр.).
  8. ↑ 1 2 Fischer, Denise D; Cai Richard; Bhatia Umesh; Asselbergs Fred A M; Song Chuanzheng; Terry Robert; Trogani Nancy; Widmer Roland; Atadja Peter; Cohen Dalia. Isolation and characterization of a novel class II histone deacetylase, HDAC10 (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — United States, 2002. — February (vol. 277, no. 8). — P. 6656—6666. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M108055200. — PMID 11739383.

Литература

  • Bonaldo M.F., Lennon G., Soares M.B. Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery (англ.) // Genome Research[англ.] : journal. — 1997. — Vol. 6, no. 9. — P. 791—806. — doi:10.1101/gr.6.9.791. — PMID 8889548.
  • Dunham I; Shimizu N; Roe BA; Bruskiewich, R.; Beare, D. M.; Clamp, M.; Smink, L. J.; Ainscough, R.; Almeida, J. P. The DNA sequence of human chromosome 22 (англ.) // Nature. — 1999. — Vol. 402, no. 6761. — P. 489—495. — doi:10.1038/990031. — PMID 10591208.
  • Fischer DD; Cai R; Bhatia U; Asselbergs, FA; Song, C; Terry, R; Trogani, N; Widmer, R; Atadja, P. Isolation and characterization of a novel class II histone deacetylase, HDAC10 (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 8. — P. 6656—6666. — doi:10.1074/jbc.M108055200. — PMID 11739383.
  • Tong J.J., Liu J., Bertos N.R., Yang X.J. Identification of HDAC10, a novel class II human histone deacetylase containing a leucine-rich domain (англ.) // Nucleic Acids Research[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 30, no. 5. — P. 1114—1123. — doi:10.1093/nar/30.5.1114. — PMID 11861901. — PMC 101247.
  • Strausberg RL; Feingold EA; Grouse LH; Derge, JG; Klausner, RD; Collins, FS; Wagner, L; Shenmen, CM; Schuler, G.D. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Rodriguez M., Yu X., Chen J., Songyang Z. Phosphopeptide binding specificities of BRCA1 COOH-terminal (BRCT) domains (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2004. — Vol. 278, no. 52. — P. 52914—52918. — doi:10.1074/jbc.C300407200. — PMID 14578343.
  • Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. An unappreciated role for RNA surveillance (англ.) // BioMed Central[англ.]. — 2005. — Vol. 5, no. 2. — P. R8. — doi:10.1186/gb-2004-5-2-r8. — PMID 14759258. — PMC 395752.
  • Osada H; Tatematsu Y; Saito H; Yatabe, Yasushi; Mitsudomi, Tetsuya; Takahashi, Takashi. Reduced expression of class II histone deacetylase genes is associated with poor prognosis in lung cancer patients (англ.) // International Journal of Cancer[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 112, no. 1. — P. 26—32. — doi:10.1002/ijc.20395. — PMID 15305372.
  • Collins JE; Wright CL; Edwards CA; Davis, Matthew P; Grinham, James A; Cole, Charlotte G; Goward, Melanie E; Aguado, Begoña; Mallya, Meera. A genome annotation-driven approach to cloning the human ORFeome (англ.) // BioMed Central[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 5, no. 10. — P. R84. — doi:10.1186/gb-2004-5-10-r84. — PMID 15461802. — PMC 545604.
  • Gerhard DS; Wagner L; Feingold EA; Shenmen, CM; Grouse, LH; Schuler, G; Klein, SL; Old, S; Rasooly, R. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Research[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.