DZIP3 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | DZIP3, PPP1R66, UURF2, hRUL138, DAZ interacting zinc finger protein 3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608672 MGI: 1917433 HomoloGene: 8771 GeneCards: DZIP3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • phosphatase binding • polyubiquitin modification-dependent protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • RNA binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity • unfolded protein binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • ubiquitin-specific protease binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • Hrd1p ubiquitin ligase complex • Derlin-1 retrotranslocation complex • endoplasmic reticulum quality control compartment |
---|
Біологічний процес | • protein polyubiquitination • Убіквітин-залежний протеоліз • ubiquitin-dependent ERAD pathway • Відповідь на незгорнуті білки |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001110017 NM_027341 NM_001356425 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001103487 NP_081617 NP_001343354 |
|
---|
Локус (UCSC) | н/д | Хр. 16: 48.74 – 48.81 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
DZIP3 (англ. DAZ interacting zinc finger protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 208 амінокислот, а молекулярна маса — 138 604[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDSLPDEFFV | | RHPAVEDQRK | | EETENKLEKS | | SGQLNKQEND | | IPTDLVPVNL |
LLEVKKLLNA | | INTLPKGVVP | | HIKKFLQEDF | | SFQTMQREVA | | ANSQNGEEIV |
PALTLRFLIT | | QLEAALRNIQ | | AGNYTAHQIN | | IGYYLTLLFL | | YGVALTERGK |
KEDYTEAENK | | FLVMKMMIQE | | NEICENFMSL | | VYFGRGLLRC | | AQKRYNGGLL |
EFHKSLQEIG | | DKNDHWFDID | | PTEDEDLPTT | | FKDLLNNFIK | | TTESNIMKQT |
ICSYLDCERS | | CEADILKNTS | | YKGFFQLMCS | | KSCCVYFHKI | | CWKKFKNLKY |
PGENDQSFSG | | KKCLKEGCTG | | DMVRMLQCDV | | PGIVKILFEV | | VRKDEYITIE |
NLGASYRKLI | | SLKITDTDIR | | PKISLKFNTK | | DEMPIFKLDY | | NYFYHLLHII |
IISGTDIVRQ | | IFDEAMPPPL | | LKKELLIHKN | | VLESYYNHLW | | TNHPLGGSWH |
LLYPPNKELP | | QSKQFDLCLL | | LALIKHLNVF | | PAPKKGWNME | | PPSSDISKSA |
DILRLCKYRD | | ILLSEILMNG | | LTESQFNSIW | | KKVSDILLRL | | GMMQEDIDKV |
KENPIENISL | | DYHQLSVYLG | | IPVPEIIQRM | | LSCYQQGIAL | | QSITGSQRIE |
IEELQNEEEE | | LSPPLMEYNI | | NVKSHPEIQF | | AEINKDGTSI | | PSESSTESLK |
DLQEVKSKQR | | KKKKTKNKKN | | KDSKEDQVPY | | VVEKEEQLRK | | EQANPHSVSR |
LIKDDASDVQ | | EDSAMEDKFY | | SLDELHILDM | | IEQGSAGKVT | | TDYGETEKER |
LARQRQLYKL | | HYQCEDFKRQ | | LRTVTFRWQE | | NQMQIKKKDK | | IIASLNQQVA |
FGINKVSKLQ | | RQIHAKDNEI | | KNLKEQLSMK | | RSQWEMEKHN | | LESTMKTYVS |
KLNAETSRAL | | TAEVYFLQCR | | RDFGLLHLEQ | | TEKECLNQLA | | RVTHMAASNL |
ESLQLKAAVD | | SWNAIVADVR | | NKIAFLRTQY | | NEQINKVKQG | | FALSTLPPVQ |
LPPPPPSPEI | | LMQQFLGRPL | | VKESFFRPIL | | TVPQMPAVCP | | GVVSATGQPR |
APLMTGIAWA | | LPAPVGDAVP | | PSAGLRSDPS | | IMNWERITDR | | LKTAFPQQTR |
KELTDFLRKL | | KDAYGKSLSE | | LTFDEIVCKI | | SQFIDPKKSQ | | SQGKSVSNVN |
CVSPSHSPSQ | | PDAAQPPKPA | | WRPLTSQGPA | | TWEGASNPDE | | EEEEEEPCVI |
CHENLSPENL | | SVLPCAHKFH | | AQCIRPWLMQ | | QGTCPTCRLH | | VLLPEEFPGH |
PSRQLPKI |
Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- Kreft S.G., Nassal M. (2003). hRUL138, a novel human RNA-binding RING-H2 ubiquitin-protein ligase. J. Cell Sci. 116: 605—616. PMID 12538761 DOI:10.1242/jcs.00261
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30938 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q86Y13 (англ.) . Архів оригіналу за 22 листопада 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |