NRAP |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | NRAP, N-RAP, nebulin related anchoring protein |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602873 MGI: 1098765 HomoloGene: 4499 GeneCards: NRAP |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • actin binding • зв'язування з іоном металу • muscle alpha-actinin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin filament binding |
---|
Клітинна компонента | • fascia adherens • muscle tendon junction • Z disc |
---|
Біологічний процес | • GO:0022610 життєдіяльність • cardiac muscle thin filament assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001261463 NM_006175 NM_198060 NM_001322945 |
| | NM_001286552 NM_008733 NM_198059 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001248392 NP_001309874 NP_006166 NP_932326 |
| NP_001273481 NP_032759 NP_932307 NP_001390105 NP_001390107
| NP_001390109 NP_001390113 NP_001390114 NP_001390115 NP_001390116 NP_001390117 NP_001390119 NP_001390120 NP_001390121 NP_001390122 NP_001390123 NP_001390124 NP_001390125 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 10: 113.59 – 113.66 Mb | Хр. 19: 56.31 – 56.38 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
NRAP (англ. Nebulin related anchoring protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 730 амінокислот, а молекулярна маса — 197 074[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNVQPCSRCG | | YGVYPAEKIS | | CIDQIWHKAC | | FHCEVCKMML | | SVNNFVSHQK |
KPYCHAHNPK | | NNTFTSVYHT | | PLNLNVRTFP | | EAISGIHDQE | | DGEQCKSVFH |
WDMKSKDKEG | | APNRQPLANE | | RAYWTGYGEG | | NAWCPGALPD | | PEIVRMVEAR |
KSLGEEYTED | | YEQPRGKGSF | | PAMITPAYQR | | AKKANQLASQ | | VEYKRGHDER |
ISRFSTVVDT | | PELLRSKAGA | | QLQSDVRYTE | | DYEQQRGKGS | | FPAMITPAYQ |
IAKRANELAS | | DVRYHQQYQK | | EMRGMAGPAI | | GAEGILTREC | | ADQYGQGYPE |
EYEEHRGKGS | | FPAMITPAYQ | | NAKKAHELAS | | DIKYRQDFNK | | MKGAAHYHSL |
PAQDNLVLKQ | | AQSVNKLVSE | | VEYKKDLESS | | RGHSINYCET | | PQFRNVSKIS |
KFTSDNKYKE | | NYQNHMRGRY | | EGVGMDRRTL | | HAMKVGSLAS | | NVAYKADYKH |
DIVDYNYPAT | | LTPSYQTAMK | | LVPLKDANYR | | QSIDKLKYSS | | VTDTPQIVQA |
KINAQQLSHV | | NYRADYEKNK | | LNYTLPQDVP | | QLVKAKTNAK | | LFSEVKYKEG |
WEKTKGKGFE | | MKLDAMSLLA | | AKASGELASN | | IKYKEEYEKT | | KGKAMGTADS |
RLLHSLQIAK | | MSSEVEYKKG | | FEESKTRFHL | | PMDMVNIRHA | | KKAQTLASDL |
DYRKKLHEYT | | VLPEDMKTQW | | AKKAYGLQSE | | LQYKADLAWM | | KGVGWLTEGS |
LNLEQAKKAG | | QLVSEKNYRQ | | RVDELKFTSV | | TDSSQMEHAK | | KSQELQSGVA |
YKAGNEQSVH | | QYTISKDEPL | | FLQARANAAN | | LSEKLYKSSW | | ENQKAKGFEL |
RLDSLTFLAA | | KAKRDLASEV | | KYKEDYERSR | | GKLIGAKDVQ | | GDSQMSHSLQ |
MSKLQSELEY | | KKGFEDTKSQ | | CHVSLDMVHL | | VHARKAQHLA | | TDVGYKTAEH |
HFTALPTDMK | | VEWAKKAYGL | | QSDNQYRADV | | KWMKGMGWVA | | TGSLNVEQAK |
KAGELISEKK | | YRQHPDALKF | | TSIKDTPEMV | | QARISYTQAV | | DRLYREQGEN |
IKHHYTPTAD | | LPEVLLAKLN | | AMNISETRYK | | ESWSKLRDGG | | YKLRLDALPF |
QAAKASGEII | | SDYKYKEAFE | | KMKGQMLGSR | | SLEDDISLAH | | SVYATSLQSD |
VNYKKGFEHS | | KAQFHLPLDM | | AALVHAKKAQ | | TLASNQDYKH | | PLPQYTSLAE |
DLRLSCAKKA | | HKLQSENLYR | | SDLNFMRGVA | | CVIPGTLEIE | | GRKKASELIS |
ESKYRQHPHS | | FKYTAVTDTP | | NLLHAKFSNQ | | ITNERLYKAA | | GEDARHEYTM |
TLGLPEFIRA | | KTNAANLSDA | | RYKESWRNLR | | AQGYKLTIEA | | LPFQAARASG |
DIASDFLYRH | | DFVKERGKLI | | GPQSVRDDPR | | IQHCRRMGQL | | QSELQYRRGA |
TSSQAQFHLP | | MDMVHLVHAK | | NAQALASDHD | | YRTQYHKFTA | | LPEDLKMAWA |
KKAHALQSEL | | RYKSDLIGMK | | GIGWLALRSP | | QMESAKKAGE | | LISETKYRKK |
PDSIKFTTVV | | DSPDLVHAKN | | SYMHCNERMY | | RSGDAESLHR | | YTLIPDHPDF |
TRARLNALHL | | SDKVYRNSWE | | QTRAGSYDFR | | LDAIPFQTAR | | ASREIASDFR |
YKEAFLRDRG | | LQIGYRSVDD | | DPRMKHFLNV | | GRLQSDNEYK | | KDFAKSRSQF |
HSSTDQPGLL | | QAKRSQQLAS | | DVHYRQPLPQ | | PTCDPEQLGL | | RHAQKAHQLQ |
SDVKYKSDLN | | LTRGVGWTPP | | GSYKVEMARR | | AAELANARGL | | GLQGAYRGAE |
AVEAGDHQSG | | EVNPDATEIL | | HVKKKKALLL |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іонами металів, іоном цинку.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Luo G., Leroy E., Kozak C.A., Polymeropoulos M.H., Horowits R. (1997). Mapping of the gene (NRAP) encoding N-RAP in the mouse and human genomes. Genomics. 45: 229—232. PMID 9339382 DOI:10.1006/geno.1997.4917
- Gehmlich K., Geier C., Osterziel K.J., Van der Ven P.F., Fuerst D.O. (2004). Decreased interactions of mutant muscle LIM protein (MLP) with N-RAP and alpha-actinin and their implication for hypertrophic cardiomyopathy. Cell Tissue Res. 317: 129—136. PMID 15205937 DOI:10.1007/s00441-004-0873-y
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7988 (англ.) . Архів оригіналу за 25 березня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q86VF7 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |