SNAPC4

Ідентифікатори

Символи

SNAPC4, PTFalpha, SNAP190, small nuclear RNA activating complex polypeptide 4

Зовнішні ІД

OMIM: 602777 MGI: 2443935 HomoloGene: 2321 GeneCards: SNAPC4

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • snRNA-activating protein complex
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • snRNA transcription by RNA polymerase III • transcription by RNA polymerase III • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • snRNA transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин • snRNA transcription
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6621


227644

Ensembl


ENSG00000165684


ENSMUSG00000036281

UniProt


Q5SXM2


Q8BP86

RefSeq (мРНК)


NM_003086 NM_001394201 NM_001394202 NM_001394203


NM_001290419 NM_172339

RefSeq (білок)


NP_003077

NP_001277348 NP_758842 NP_001393660 NP_001393661 NP_001393662
NP_001393663 NP_001393664 NP_001393665 NP_001393666 NP_001393667 NP_001393668

Локус (UCSC)

Хр. 9: 136.38 – 136.4 Mb

Хр. 2: 26.25 – 26.27 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SNAPC4 (англ. Small nuclear RNA activating complex polypeptide 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 469 амінокислот, а молекулярна маса — 159 433^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDVDAEREKI	TQEIKELERI	LDPGSSGSHV	EISESSLESD	SEADSLPSED
LDPADPPISE	EERWGEASND	EDDPKDKTLP	EDPETCLQLN	MVYQEVIQEK
LAEANLLLAQ	NREQQEELMR	DLAGSKGTKV	KDGKSLPPST	YMGHFMKPYF
KDKVTGVGPP	ANEDTREKAA	QGIKAFEELL	VTKWKNWEKA	LLRKSVVSDR
LQRLLQPKLL	KLEYLHQKQS	KVSSELERQA	LEKQGREAEK	EIQDINQLPE
EALLGNRLDS	HDWEKISNIN	FEGSRSAEEI	RKFWQNSEHP	SINKQEWSRE
EEERLQAIAA	AHGHLEWQKI	AEELGTSRSA	FQCLQKFQQH	NKALKRKEWT
EEEDRMLTQL	VQEMRVGSHI	PYRRIVYYME	GRDSMQLIYR	WTKSLDPGLK
KGYWAPEEDA	KLLQAVAKYG	EQDWFKIREE	VPGRSDAQCR	DRYLRRLHFS
LKKGRWNLKE	EEQLIELIEK	YGVGHWAKIA	SELPHRSGSQ	CLSKWKIMMG
KKQGLRRRRR	RARHSVRWSS	TSSSGSSSGS	SGGSSSSSSS	SSEEDEPEQA
QAGEGDRALL	SPQYMVPDMD	LWVPARQSTS	QPWRGGAGAW	LGGPAASLSP
PKGSSASQGG	SKEASTTAAA	PGEETSPVQV	PARAHGPVPR	SAQASHSADT
RPAGAEKQAL	EGGRRLLTVP	VETVLRVLRA	NTAARSCTQK	EQLRQPPLPT
SSPGVSSGDS	VARSHVQWLR	HRATQSGQRR	WRHALHRRLL	NRRLLLAVTP
WVGDVVVPCT	QASQRPAVVQ	TQADGLREQL	QQARLASTPV	FTLFTQLFHI
DTAGCLEVVR	ERKALPPRLP	QAGARDPPVH	LLQASSSAQS	TPGHLFPNVP
AQEASKSASH	KGSRRLASSR	VERTLPQASL	LASTGPRPKP	KTVSELLQEK
RLQEARAREA	TRGPVVLPSQ	LLVSSSVILQ	PPLPHTPHGR	PAPGPTVLNV
PLSGPGAPAA	AKPGTSGSWQ	EAGTSAKDKR	LSTMQALPLA	PVFSEAEGTA
PAASQAPALG	PGQISVSCPE	SGLGQSQAPA	ASRKQGLPEA	PPFLPAAPSP
TPLPVQPLSL	THIGGPHVAT	SVPLPVTWVL	TAQGLLPVPV	PAVVSLPRPA
GTPGPAGLLA	TLLPPLTETR	AAQGPRAPAL	SSSWQPPANM	NREPEPSCRT
DTPAPPTHAL	SQSPAEADGS	VAFVPGEAQV	AREIPEPRTS	SHADPPEAEP
PWSGRLPAFG	GVIPATEPRG	TPGSPSGTQE	PRGPLGLEKL	PLRQPGPEKG
ALDLEKPPLP	QPGPEKGALD	LGLLSQEGEA	ATQQWLGGQR	GVRVPLLGSR
LPYQPPALCS	LRALSGLLLH	KKALEHKATS	LVVGGEAERP	AGALQASLGL
VRGQLQDNPA	YLLLRARFLA	AFTLPALLAT	LAPQGVRTTL	SVPSRVGSES
EDEDLLSELE	LADRDGQPGC	TTATCPIQGA	PDSGKCSASS	CLDTSNDPDD
LDVLRTRHAR	HTRKRRRLV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Ma B., Hernandez N. (2001). A map of protein-protein contacts within the small nuclear RNA-activating protein complex SNAPc. J. Biol. Chem. 276: 5027—5035. PMID 11056176 DOI:10.1074/jbc.M009301200
Hinkley C.S., Hirsch H.A., Gu L., LaMere B., Henry R.W. (2003). The small nuclear RNA-activating protein 190 Myb DNA binding domain stimulates TATA box-binding protein-TATA box recognition. J. Biol. Chem. 278: 18649—18657. PMID 12621023 DOI:10.1074/jbc.M204247200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11137 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q5SXM2 (англ.) . Архів оригіналу за 2 лютого 2017. Процитовано 7 вересня 2017.