SNTG1 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

SNTG1

Ідентифікатори

Символи

SNTG1, G1SYN, SYN4, syntrophin gamma 1

Зовнішні ІД

OMIM: 608714 MGI: 1918346 HomoloGene: 56834 GeneCards: SNTG1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• actin binding • protein C-terminus binding • structural molecule activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • ruffle membrane • syntrophin complex • цитоскелет • клітинне ядро • dystrophin-associated glycoprotein complex
Біологічний процес	• cell communication
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


54212


71096

Ensembl


ENSG00000147481


ENSMUSG00000025909

UniProt


Q9NSN8


Q925E1

RefSeq (мРНК)

NM_001287813 NM_001287814 NM_018967 NM_001321773 NM_001321775
NM_001321776 NM_001321777 NM_001321778


NM_001290390 NM_001290392 NM_001290393 NM_027671

RefSeq (білок)

NP_001274742 NP_001274743 NP_001308702 NP_001308704 NP_001308705
NP_001308706 NP_001308707 NP_061840 NP_001274742.1 NP_061840.1 NP_001308702.1


NP_001277319 NP_001277321 NP_001277322 NP_081947

Локус (UCSC)

Хр. 8: 49.91 – 50.8 Mb

Хр. 1: 8.36 – 9.3 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SNTG1 (англ. Syntrophin gamma 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 517 амінокислот, а молекулярна маса — 57 969^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDFRTACEET	KTGICLLQDG	NQEPFKVRLH	LAKDILMIQE	QDVICVSGEP
FYSGERTVTI	RRQTVGGFGL	SIKGGAEHNI	PVVVSKISKE	QRAELSGLLF
IGDAILQING	INVRKCRHEE	VVQVLRNAGE	EVTLTVSFLK	RAPAFLKLPL
NEDCACAPSD	QSSGTSSPLC	DSGLHLNYHP	NNTDTLSCSS	WPTSPGLRWE
KRWCDLRLIP	LLHSRFSQYV	PGTDLSRQNA	FQVIAVDGVC	TGIIQCLSAE
DCVDWLQAIA	TNISNLTKHN	IKKINRNFPV	NQQIVYMGWC	EAREQDPLQD
RVYSPTFLAL	RGSCLYKFLA	PPVTTWDWTR	AEKTFSVYEI	MCKILKDSDL
LDRRKQCFTV	QSESGEDLYF	SVELESDLAQ	WERAFQTATF	LEVERIQCKT
YACVLESHLM	GLTIDFSTGF	ICFDAATKAV	LWRYKFSQLK	GSSDDGKSKI
KFLFQNPDTK	QIEAKELEFS	NLFAVLHCIH	SFFAAKVACL	DPLFLGNQAT
ASTAASSATT	SKAKYTT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13740 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NSN8 (англ.) . Архів оригіналу за 29 грудня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.